A administração do empreendimento é exercida pela Associação Alphaville, no sistema de autogestão, o que garante o padrão Alphaville nos residenciais.
Mantida pelos proprietários (associados), a Associação é responsável pela gestão de todas as atividades das áreas residenciais e comerciais do Alphaville São José dos Campos administrando desde a manutenção estrutural, investimentos em melhorias e comodidade para os associados, administração da área de lazer e segurança.